Οι ερευνητικές δραστηριότητες του Τμήματος πραγματοποιούνται στα Εργαστήρια/Ομάδες του Τμήματος που είναι:
- Ερευνητική ομάδα Μοντελοποίησης Δυναμικών Συστημάτων
- Εργαστήριο Ταλαντώσεων, Ανάλυσης και Επεξεργασίας Σήματος
- Εργαστήριο Ρομποτικής και Αυτοματισμών
- Εργαστήριο Βιοϊατρικής Υπερήχων
- Εργαστήριο Ρομποτικής Αποκατάστασης
- Εργαστήριο Βιοφυσικής του Καρκίνου (www.ucy.ac.cy/cancer_biophysics/en)
- Εργαστήριο Υπολογιστικής Μηχανικής (ucy-compsci.org)
- Ερευνητική ομάδα In silico Μοντελοποίησης (www.eng.ucy.ac.cy/vvavourakis)
- Εργαστήριο Σύνθετων λειτουργικών Υλικών (http://www.ucy.ac.cy/complexfunctionalmaterialslab/en/)
- Εργαστήριο Νανοδομημένων Υλικών και Διατάξεων
- Εργαστήριο Μηχανικής Επιφανειών
- Εργαστήριο Τεχνολογίας Κόνεως (http://www.eng.ucy.ac.cy/kyratsi/)
- Εργαστήριο Σύνθεσης και Κατεργασίας Πολυμερών (http://www.ucy.ac.cy/polymerlab/)